冷水机去除污垢的主要部件有：冷凝器、蒸发器以及循环水管道等。
（一）冷凝器：
冷凝器的除垢分为水冷和风冷。对于风冷冷凝器来说，清洗主要是清除冷冻机冷凝器灰尘的污垢，灰尘污垢也可以使用除垢剂来清除，当然，除垢工作应该周期化和定期化，否则，将影响冷冻机正常使用。
对于水冷冷凝器来说，清洗主要是除水垢，水垢相对更难清洗和清理，必须要使用除垢剂，以及配合清洗泵和配液箱等设备。
（二）蒸发器
蒸发器外部往往会产生水垢，这是因为蒸发器必须要置于冷冻水中，才能够将内部管内冷媒蒸发吸热产生的冷量赋予到冷冻水中。蒸发器的除垢也比较重要，否则制冷效果也会受到影响。
（三）循环水管路
需要确定好清洗、除垢需要使用的除垢剂，并且保证除垢剂适用于冷冻机的管道清理和部件清理，大多数除垢剂都是酸性的，这也就是通常意义上所说的酸洗，酸洗的话，必须要掌握好浓度配比，否则将会极容易导致冷冻机内部腐蚀。
循环水管路也是必然需要清理和清洗的。清理和清洗必须要在停机状态下进行，必须要保证系统各个阀门的开启，如果阀门不开启，则无法让冷冻机的清洗处于循环清洗状态。停机开始清洗之后，必须要先将清洗装置组成一个清理系统，根据清洗的部位的不同，来进行不同的处理，当然，也可以手工进行清理，但不借助清洗泵等设备，清洗和清理比较困难。